Заболевание у человека вызывают все те типы лептоспир, что и у животных, но в большинстве случаев обнаруживают L. ротоnа, L. canicola и L. icterohaemorrhagiae. Объясняется это тем, что человек чаще всего заражается лептоспирозом от свиней, собак и крыс. Другие типы лептоспир находят значительно реже. Хотя и установлено, что заболевают этим видом инфекции главным образом работники полеводства, садоводства, свиноводства, медицинских и ветеринарных лабораторий, гидротехнических сооружений и канализационных сетей, шахт и т. д., болезнь уже перешагнула границы профессиональной принадлежности и угрожает все большему числу людей.
Необходимо отметить, что риск заражения связан не только с определенными профессиями, и местом работы, но и со случайными, прямыми или косвенными, контактами человека со столь разнообразными источниками возбудителя болезни, а также видом иммунитета человека. Очень часто заболевают дети, которые купаются в водоемах, загрязненных выделениями животных-бактерионосителей. Распространению данной инфекционной болезни животных передающейся человеку, могут способствовать загрязненная мочой больных животных вода (болота, пруды, рисовые поля, фонтаны). Вызвать инфекцию может зараженная почва, если ходить по ней босиком (земледельцы, скотоводы).
Сточные воды свиноводческих комплексов являются важным источником возбудителя лептоспироза. Лептоспиры проникают в организм через поврежденные участки кожи и слизистые оболочки (слизистая ротовой полости, конъюнктива глаз и т. д.). Описаны эпидемии, вызванные потреблением питьевой воды, зараженной лептоспирами (L. icterohaemorrhagiae или L. ротопа), и при купании (L. canicola). Известны случаи заражения вследствие потребления овощей, молока или мяса, дегустации сырой крови при изготовлении колбас и т. д.
Попавшие в организм лептоспиры проникают в кровяное русло, где размножаются (септическая фаза, сопровождающаяся лихорадкой). В крови их можно обнаружить в течение первых 4—5 дней болезни, если ввести ее морским свинкам. На этой фазе лептоспир находяттакже в различных органах: почках, печени, селезенке, сердце, скелетной мускулатуре, стенках сосудов, стенках пищеварительного тракта и т. п. В то время когда появляется желтуха, лептоспиры исчезают из крови и содержание их в большинстве органов уменьшается, за исключением почек, скелетной мускулатуры и миокарда, где их можно найти и на 17-й день болезни. В моче они появляются в конце первой недели.