У свиней инкубационный период гриппа длится от 2 до 7 дней, в среднем 4 дня. Симптомы гриппа начинаются лихорадкой, температура тела достигает 40—41°С, наблюдаются состояние глубокой прострации, отказ от корма. Первые случаи заболевания возникают неожиданно и всегда отличаются острым течением. С 1-го или 2-го дня болезни появляются конъюнктивит, слизисто-гнойное истечение из носа, кашель и чихание. У некоторых животных наблюдается носовое кровотечение. Вокруг ноздрей образуются корки вследствие высыхания истечений из носа.
Из-за отека верхних дыхательных путей дыхание становится затрудненным, поэтому для его облегчения животные принимают позу сидячей собаки. В дальнейшем могут появиться признаки пневмонии. Кашель становится сильным, болезненным, часто приступами и появляется, когда животных заставляют двигаться. Вследствие возникновения экссудативных процессов в суставах животные двигаются с трудом и хромают. В этот период животные быстро худеют, теряя иногда более 2 кг в день. Несмотря на быстрое ухудшение состояния, которое производит впечатление близости смертельного исхода, и высокую заболеваемость, приближающуюся к 100%, смертельность не превышает 2—4%.
У лошадей период инкубации гриппа длится от 3 до 7 дней, иногда меньше. У животных, выполняющих тяжелые работы и находящихся в плохих условиях содержания, течение гриппа более тяжелое. Заболевание начинается внезапно, интенсивность проявления симптомов достигает максимума на 2-й день. Температура тела достигает 40—42 СС с некоторой ремиссией по утрам. Одновременно животное впадает в состояние глубокой депрессии, апатии и сонливости. Аппетит уменьшается или исчезает, пульс ускоренный, слабый. В то же время отмечают катар слизистых оболочек.
Конъюнктива воспалена с оттенком желтушности, повышено слезотечение, веки отекшие. Катаральный конъюнктивит может перейти в гнойный, сопровождающийся кератитом и помутнением роговицы. У больных животных отмечают катар слизистой оболочки ротовой полости, колики и запор, вслед за которым появляется диарея, а также катар слизистой оболочки носа, подчелюстной лимфаденит, учащенное дыхание, кашель и хрипы в легких. Появляются отеки подкожной клетчатки в области шеи, живота, грудины и на конечностях.
Течение гриппа в общем доброкачественное. Температура снижается через 2—7, редко 8—15 дней, что сопровождается, как правило, смягчением и исчезновением клинических признаков болезни. Осложнения возникают чаще всего у тех лошадей, которых используют на тяжелых работах спустя слишком короткое время после клинического выздоровления. Тяжесть этих осложнений различна, иногда они оканчиваются гибелью животного. Могут появиться пневмонии, панофтальмии, подкожные флегмоны, острые нефриты, орхиты, артриты, тендовагиниты, параличи сфинктеров (мочевого пузыря и анального), тяжелые гастроэнтериты, менингиты, петехиальная горячка, ревматическое воспаление копыт, а у жеребых кобыл аборт.
У птиц клиническая картина разнообразна, что зависит в первую очередь от подтипа и свойств штамма возбудителя. Болезнь поражает как цыплят, так и взрослую птицу; преобладающие симптомы — респираторные или кишечные, иногда встречается бессимптомное течение болезни. Кишечная форма начинается с депрессии, сонливости, цианоза гребня и сережек, после чего появляется диарея, птица впадает в коматозное состояние и погибает.
Наиболее часто встречающаяся респираторная форма гриппа отличается угнетенным состоянием, сонливостью, различными респираторными шумами, замедлением развития. Болезнь продолжается 2—3 недели, смертельность не превышает 5—10%- Следует указать, что при некоторых гриппозных инфекциях у птиц единственным проявлением болезни может быть снижение яйценоскости и привеса.